MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 86268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019675	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
2	NC_019675	CTG	2	6	174	179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701341
3	NC_019675	GGCT	2	8	210	217	0 %	25 %	50 %	25 %	427701341
4	NC_019675	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
5	NC_019675	GCCG	2	8	264	271	0 %	0 %	50 %	50 %	427701341
6	NC_019675	GTGGAG	2	12	282	293	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	427701341
7	NC_019675	GGGC	2	8	317	324	0 %	0 %	75 %	25 %	427701341
8	NC_019675	TGG	2	6	334	339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
9	NC_019675	CCG	2	6	369	374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
10	NC_019675	GCC	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
11	NC_019675	GCC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
12	NC_019675	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
13	NC_019675	GGGC	2	8	463	470	0 %	0 %	75 %	25 %	427701341
14	NC_019675	GTG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
15	NC_019675	CCGGG	2	10	558	567	0 %	0 %	60 %	40 %	427701341
16	NC_019675	GCG	2	6	589	594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
17	NC_019675	GCC	2	6	759	764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
18	NC_019675	TGG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
19	NC_019675	AGG	2	6	817	822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701341
20	NC_019675	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427701341
21	NC_019675	GGCC	2	8	854	861	0 %	0 %	50 %	50 %	427701341
22	NC_019675	C	6	6	888	893	0 %	0 %	0 %	100 %	427701341
23	NC_019675	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701341
24	NC_019675	GCGGAG	2	12	1005	1016	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	427701341
25	NC_019675	TCGC	2	8	1149	1156	0 %	25 %	25 %	50 %	427701341
26	NC_019675	C	6	6	1195	1200	0 %	0 %	0 %	100 %	427701341
27	NC_019675	GAG	2	6	1245	1250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701341
28	NC_019675	CGG	2	6	1358	1363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
29	NC_019675	GAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701341
30	NC_019675	CAG	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
31	NC_019675	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
32	NC_019675	GCA	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
33	NC_019675	GCC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
34	NC_019675	GCCGG	2	10	1517	1526	0 %	0 %	60 %	40 %	427701342
35	NC_019675	GAT	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
36	NC_019675	GTC	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
37	NC_019675	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701342
38	NC_019675	GGTC	2	8	1595	1602	0 %	25 %	50 %	25 %	427701342
39	NC_019675	GAA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701342
40	NC_019675	GCG	2	6	1713	1718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
41	NC_019675	GGC	3	9	1737	1745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
42	NC_019675	CCG	2	6	1772	1777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
43	NC_019675	CAG	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
44	NC_019675	AGT	2	6	1817	1822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
45	NC_019675	GAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701342
46	NC_019675	AGA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701342
47	NC_019675	CAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
48	NC_019675	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427701342
49	NC_019675	GCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
50	NC_019675	CCGG	2	8	1994	2001	0 %	0 %	50 %	50 %	427701342
51	NC_019675	GTA	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
52	NC_019675	TCG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
53	NC_019675	CGC	2	6	2033	2038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
54	NC_019675	CTT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427701342
55	NC_019675	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
56	NC_019675	CAC	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
57	NC_019675	CGC	2	6	2175	2180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
58	NC_019675	CGT	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
59	NC_019675	TGCCGG	2	12	2192	2203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427701342
60	NC_019675	GCCG	2	8	2204	2211	0 %	0 %	50 %	50 %	427701342
61	NC_019675	G	6	6	2232	2237	0 %	0 %	100 %	0 %	427701342
62	NC_019675	CAG	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
63	NC_019675	GGC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
64	NC_019675	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701342
65	NC_019675	CGG	2	6	2369	2374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
66	NC_019675	CGT	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
67	NC_019675	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
68	NC_019675	CCA	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
69	NC_019675	CGT	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
70	NC_019675	CG	3	6	2474	2479	0 %	0 %	50 %	50 %	427701343
71	NC_019675	TCC	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701343
72	NC_019675	TCG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701343
73	NC_019675	GC	3	6	2522	2527	0 %	0 %	50 %	50 %	427701343
74	NC_019675	CCT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701343
75	NC_019675	GTC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701343
76	NC_019675	GCG	2	6	2647	2652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701343
77	NC_019675	TCGGG	2	10	2663	2672	0 %	20 %	60 %	20 %	427701343
78	NC_019675	TCG	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
79	NC_019675	GGCG	2	8	2754	2761	0 %	0 %	75 %	25 %	427701344
80	NC_019675	GGC	3	9	2767	2775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
81	NC_019675	GGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
82	NC_019675	CGC	2	6	2913	2918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
83	NC_019675	CAG	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
84	NC_019675	TGG	2	6	3009	3014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
85	NC_019675	CTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
86	NC_019675	G	6	6	3181	3186	0 %	0 %	100 %	0 %	427701344
87	NC_019675	GCG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
88	NC_019675	CGC	3	9	3241	3249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
89	NC_019675	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701344
90	NC_019675	CCA	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
91	NC_019675	CCG	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
92	NC_019675	ATCGA	2	10	3287	3296	40 %	20 %	20 %	20 %	427701344
93	NC_019675	TCA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701344
94	NC_019675	GTG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
95	NC_019675	GCC	2	6	3431	3436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
96	NC_019675	CGA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
97	NC_019675	GGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
98	NC_019675	GCC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
99	NC_019675	GTGCC	2	10	3527	3536	0 %	20 %	40 %	40 %	427701344
100	NC_019675	GCA	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
101	NC_019675	TGG	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
102	NC_019675	CCA	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
103	NC_019675	CAG	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
104	NC_019675	GT	3	6	3776	3781	0 %	50 %	50 %	0 %	427701344
105	NC_019675	CAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
106	NC_019675	CCA	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
107	NC_019675	GCT	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
108	NC_019675	C	6	6	3823	3828	0 %	0 %	0 %	100 %	427701344
109	NC_019675	GGC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
110	NC_019675	C	6	6	3886	3891	0 %	0 %	0 %	100 %	427701345
111	NC_019675	GCC	2	6	3898	3903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
112	NC_019675	GGT	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701345
113	NC_019675	GCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
114	NC_019675	CCA	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
115	NC_019675	CGC	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
116	NC_019675	GGCCAG	2	12	3996	4007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	427701345
117	NC_019675	CCG	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
118	NC_019675	G	7	7	4084	4090	0 %	0 %	100 %	0 %	427701345
119	NC_019675	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701345
120	NC_019675	GAA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701345
121	NC_019675	CAG	3	9	4125	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
122	NC_019675	CCG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
123	NC_019675	CCA	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
124	NC_019675	CAG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
125	NC_019675	ATC	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701345
126	NC_019675	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
127	NC_019675	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
128	NC_019675	CAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
129	NC_019675	GCC	5	15	4453	4467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
130	NC_019675	CCA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
131	NC_019675	GCC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
132	NC_019675	CCG	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
133	NC_019675	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
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136	NC_019675	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
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138	NC_019675	CAG	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
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261	NC_019675	GCC	2	6	8306	8311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701348
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263	NC_019675	G	6	6	8385	8390	0 %	0 %	100 %	0 %	427701348
264	NC_019675	GAT	2	6	8478	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701349
265	NC_019675	GCC	2	6	8484	8489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701349
266	NC_019675	GCGG	2	8	8532	8539	0 %	0 %	75 %	25 %	427701349
267	NC_019675	ACCG	2	8	8580	8587	25 %	0 %	25 %	50 %	427701349
268	NC_019675	TGC	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701349
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273	NC_019675	TTG	2	6	8820	8825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427701350
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298	NC_019675	GGGTC	2	10	9804	9813	0 %	20 %	60 %	20 %	427701351
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388	NC_019675	GCC	2	6	13738	13743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701354
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